Prix Leenaards
2006     J. Huelsken
2001     R. Iggo

EMBO (European Molecular Biology Organization)
Young Investigator Award
2002    A. Trumpp
2000    P. Gönczy

Prix Friedrich Miescher
2002     J. Lingner
1998     B. Amati
1994     S. Gasser
1992     E. Nigg
1982     O. Hagenbüchle et U. Schibler
1976     H. Diggelmann 

Prix Pfizer de la recherche
2000     F. Radtke

Prix Robert Wenner (Ligue Suisse)
1999     B. Amati
1995     R. Iggo
1993     E. Nigg
1989     L. Kühn
1987     E. Buetti

Docteur honoris causa, Faculté de Médecine, Université de Uméa, Suède
1998     J.-P. Mach

Bourse START du Fonds National
1997     J. Lingner
1995     M. Peter
1993     B. Amati
1987     E. Nigg

Prix Fondation Helmut Horten
1997     M. Peter

Prix Fondation San Salvatore
1997     J.-P. Mach

Prix Max Cloëtta
1996     L. Kühn
1984     H. Diggelmann
1981     P. Cerutti
1979     J.-P. Kraehenbuhl (à l'ISREC depuis 1982)

Docteur honoris causa, Ecole PolytechniqueFédérale de Lausanne (EPFL)
1996     B. Hirt

Prix du Cancer (Ligue Suisse)
1995     B. Hirt
1980     J.-P. Mach
1975     B. Hirt
1973     J.-C. Cerottini
1969     N. Odartchenko
1967     T. Brunner
1965     R. Weil

Prix Marcel Benoist
1976     J.-C. Cerottini et T. Brunner
1995     H. Isliker

Prix Huggenberger-Bischoff
1993     S. Gasser
1989     E. Nigg
1988     P. Beard
1987     C. Reymond

Prix Otto Naegeli (Fondation Bonizzi-Theler)
1992     H. Diggelmann

Bourse Cloëtta
1984-92 O. Hagenbüchle

Prix Latsis
1991     S. Gasser

Prix Josef Steiner
1986     P. Cerutti

Prix d'encouragement de la Société Suisse de Microbiologie
1984     E. Buetti