Transcriptomique spatiale dans le mélanome – Dr Krisztian Homicsko (CHUV), Prof. Raphael Gottardo (UNIL) et Dr Pierre Moulin (CHUV)

Projet de recherche translationnelle sur la déconstruction de l’architecture spatiale de la réponse du mélanome en stade précoce à l’immunothérapie PD-1 néoadjuvante

Ce « fonds affecté », provenant d’une généreuse contribution de la Fondation ORFEO, a été attribué aux Dr Krisztian Homicsko (CHUV), Prof. Raphael Gottardo (UNIL) et Dr Pierre Moulin (CHUV) en décembre 2024 pour une durée d’une année.

Les immunothérapies sont en voie d’évolution rapide, progressant du cadre métastatique au cadre adjuvant et, plus récemment, à une stratégie néoadjuvante. Dans le cas du mélanome, les immunothérapies néoadjuvantes donnent lieu à d’excellentes réponses et à des résultats prometteurs à long terme.  Tant les monothérapies que les immunothérapies combinées se sont avérées efficaces. Cependant, il n’est pas encore possible d’identifier la stratégie la mieux adaptée à chaque patient. A l’heure actuelle, il n’existe pas encore de biomarqueurs fiables permettant de déterminer quels patients pourront bénéficier d’un traitement donné ou de définir la stratégie thérapeutique la plus appropriée. 

Compte tenu de la complexité du microenvironnement tumoral, nous visons à étudier l’architecture spatiale du mélanome avant et après l’immunothérapie néoadjuvante moyennant des méthodes de pathologie numérique et de transcriptomique spatiale à l’échelle de la cellule unique. Notre approche intègre plusieurs modalités, combinant des tests peu complexes tels que la coloration H&E et l’immunohistochimie multiplex avec la transcriptomique spatiale à haute résolution. Cette stratégie permet non seulement d’approfondir nos connaissances du microenvironnement tumoral, mais aussi de faciliter l’identification de biomarqueurs potentiels. 

Nous visons en outre à transposer les biomarqueurs identifiés grâce à la transcriptomique spatiale en méthodes d’imagerie pathologique conventionnelle, ce qui permettra de valider nos résultats dans un contexte clinique plus largement accessible.